Het Calvijn College wil een open, veilige en betrouwbare school zijn. Opvoeden kan alleen in een klimaat waarin jongeren zich veilig en thuis voelen. Veiligheid in en om de school is van groot belang.

Tekenend voor de sfeer is de afwezigheid van een kluisje voor elke leerling en detectiepoortjes. Het Calvijn College streeft ernaar invoering hiervan te voorkomen.
 
Alle locaties hebben het certificaat ‘veilige school’. Dit is door de Arbo Unie toegekend na onderzoek in 2008.
Er is integraal gekeken naar veiligheid: van de route naar school tot en met het gedrag in de school. Het Calvijn College werkt eraan dit certificaat, dat elke vier jaar onder de loep wordt genomen, te behouden.